Thermo Fisher Scientific Applied Biosystems StepOne™ Real-Time PCR System 取扱説明書

タイプ
取扱説明書
Applied Biosystems StepOne
StepOnePlus
Real-Time PCR Systems
试剂指南
Applied Biosystems StepOne
StepOnePlus Real-Time PCR
Systems
试剂指南
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SYBR is a registered trademark of Molecular Probes, Inc.
All other trademarks are the sole property of their respective owners.
部件号 4377715 Rev C
目录 Front Cover
iii
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
前言
如何使用本指南 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . vii
如何获取更多信息 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ix
如何获取支持 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xii
1 章简
关于 StepOne StepOnePlus 系统 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-2
支持的耗材 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-4
准备实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-6
选择实验类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-7
选择试剂类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-8
选择检测类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-9
2 章 试剂概述
概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-2
Taq M an® 试剂 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-2
SYBR® Green 试剂 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-4
选择适当的试剂类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-6
尽量降低 DNA 污染 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-6
3 章 定量实验
3.1 部分 :关于定量实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-3
概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-4
选择定量方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-5
选择一步法 RT-PCR 或两步法 RT-PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-7
选择单一或多重 PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-9
选择试剂类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-11
选择检测类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-11
iv Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
3.2 部分 :设计指南 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-15
Inventoried/Made to Order 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-16
TaqMan® Gene Expression Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-16
Custom TaqMan® Gene Expression Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-18
选择母液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-19
设计实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-20
Custom 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-21
使用 Primer Express® Software 设计引物和探针 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-21
选择试剂 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-24
使用建议的热循环条件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-27
优化引物浓度 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-30
优化探针浓度 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-32
有关详情 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-34
4 章 基因分型实验
4.1 部分 :关于基因分型实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-3
概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-4
选择检测类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-6
4.2 部分 :设计指南 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-9
Pre-Designed/Validated 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-10
TaqMan® SNP Genotyping Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-10
TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-11
Pre-Developed TaqMan® Assay Reagents for Allelic Discrimination . . . . . . . . . . 4-12
选择母液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-13
设计实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-14
Custom 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-14
Custom TaqMan® SNP Genotyping Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-14
选择母液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-16
设计实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-16
5 章存/不存在实验
5.1 部分:关于存在/不存在实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-3
概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-4
选择检测类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-5
v
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
5.2 部分 :设计指南 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-9
Inventoried/Made to Order 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-10
TaqMan® Gene Expression Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-10
Custom TaqMan® Gene Expression Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-12
TaqMan® Exogenous Internal Positive Control Reagents . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-13
选择母液 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-15
设计实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-16
Custom 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5-16
附录 A 公式
使用标准曲线法计算标准差 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A-2
使用比较法计算标准差 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A-5
比较 CT (∆∆CT) 实验的公式 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A-7
附录 B 多重 PCR 中的引物限制
附录 C 检测设计指南
附录 D 试剂部件号
定量实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-2
Inventoried/Made to Order 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-2
Custom 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-2
基因分型实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-5
Pre-Designed/Validated 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-5
Custom 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-6
存在/不存在实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-7
Inventoried/Made to Order 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-7
Custom 检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D-8
参考文献
术语表
索引
vi Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
vii
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
前言
如何使用本指南
关于系统说明文档 下文所列指南随 Applied Biosystems StepOne StepOnePlus Real-Time PCR
Systems (以下简称 “StepOne StepOnePlus 系统”)一起提供。
注意:本手册中使用 Applied Biosystems StepOneTM StepOnePlusTM Real-
Time PCR Systems 指两种产品:Applied Biosystems StepOneTM Real-Time PCR
System Applied Biosystems StepOnePlusTM Real-Time PCR System
指南 目的和目标读者 部件号
中文版
部件号
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems Getting
Started Guide for Genotyping Experiments
说明如何在 StepOne StepOnePlus 系统
上执行实验。每个入门指南都可用作:
教程,使用随 Applied Biosystems
StepOne Real-Time PCR Software (以
下简称 “StepOne 软件”)提供的示例
实验数据。
您自己执行实验的指南。
专为使用 StepOne StepOnePlus 系统执
行实验的实验室人员及主要研究人员而编写。
4376786 4377732
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems Getting
Started Guide for Presence/Absence
Experiments
4376787 4377721
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems Getting
Started Guide for Relative Standard Curve and
Comparative CT Experiments
4376785 4377739
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems Getting
Started Guide for Standard Curve Experiments
4376784 4377733
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems
Installation, Networking, and Maintenance
Guide
说明如何安装和维护 StepOne
StepOnePlus 系统。
专为负责安装和维护 StepOne
StepOnePlus 系统的实验室人员而编写。
4376782 4377795
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems
Installation Quick Reference Card
4376783 4377789
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems
Reagent Guide
提供有关您可在 StepOne StepOnePlus
系统上使用的试剂的信息,包括:
•TaqMan
® SYBR® Green 试剂简介
以下实验类型的描述和设计指南:
定量实验
基因分型实验
存在/不存在实验
专为使用 StepOne StepOnePlus 系统执
行实验的实验室人员及主要研究人员而编写。
4379704 4377715
viii Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
前言
假定 本指南假定您已具备以下条件:
熟悉 Microsoft Windows® XP 操作系统。
熟悉因特网和因特网浏览器。
熟悉如何处理 DNA / RNA 样本并为 PCR 扩增准备这些样本。
熟悉数据存储、文件传输以及复制和粘贴操作。
若您计划将 StepOne StepOnePlus 系统集成到您的现有实验室数据流
中,则需具备联网经验。
文字体例 本指南采用以下体例:
粗体文字表示用户操作。例如:
键入 0,然后对剩余的每个字段按一下 Enter 键。
斜体
文字表示新的或重要的内容,也用于表示强调。例如:
在开始分析之前,请
始终
准备好新鲜基质。
右箭头符号 () 用于分开您从下拉菜单或快捷菜单中依次选择的多个命
令。例如:
依次选择 File (文件) Open (打开)
用户警示文字 Applied Biosystems 用户文档中,有两种用户警示文字。每种警示文字表示
需遵守事项或执行操作的不同重要性级别,如下所述:
注意: 提供使用产品的用户可能有兴趣或有帮助的信息,但并非使用产品
不可或缺的事项或操作。
切记! 提供正确操作仪器、精确使用试剂盒或确保安全使用某化学品所必
须遵守的要求或必须执行的操作
Applied Biosystems StepOne and
StepOnePlus Real-Time PCR Systems Site
Preparation Guide
说明如何准备场地以接收和安装 StepOne
StepOnePlus 系统。
专为为准备场地以便安装 StepOne
StepOnePlus 系统所需的任务制定日程表、
管理以及执行这些任务的工作人员而编写。
4376768 4378356
Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR
Software Help
说明如何使用 StepOne 软件以便:
使用 StepOne StepOnePlus 系统设
置、运行和分析实验。
监视联网的 StepOne StepOnePlus
增仪。
校准 StepOne StepOnePlus 扩增仪。
使用 RNase P 实验验证 StepOne
StepOnePlus 扩增仪的性能。
专为以下人员而编写:
使用 StepOne StepOnePlus 系统执行
实验的实验室人员及主要研究人员。
负责安装和维护 StepOne
StepOnePlus 系统的实验室人员。
未提供 未提供
指南 目的和目标读者 部件号
中文版
部件号
ix
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
前言
用户警示文字示例如下:
注意: 在控制台也可使用 Calibrate (校准)功能。
切记! 要验证您的客户机连接,您需要一个有效用户 ID
安全警示文字 用户文档中也包括安全警示文字。有关详情,请参阅 xii 页 “安全警示文
字”
如何获取更多信息
相关文档 其它 StepOne StepOnePlus 系统文档
下面表格中所列的文档不随 StepOne StepOnePlus 扩增仪提供。
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Applied Biosystems StepOne and StepOnePlus Real-Time PCR
Systems Installation Performance Verification Protocol
4376791
Applied Biosystems StepOne and StepOnePlus Real-Time PCR
Systems Installation Qualification-Operation Qualification Protocol
4376790
Applied Biosystems StepOne and StepOnePlus Real-Time PCR
Systems Planned Maintenance Protocol
4376788
文档 部件号
Allelic Discrimination Pre-Developed TaqMan® Assay Reagents Quick
Reference Card
4312212
Custom TaqMan® Genomic Assays Protocol 4367671
Custom TaqMan® SNP Genotyping Assays Protocol 4334431
Ordering TaqMan® SNP Genotyping Assays Quick Reference Card 4374204
Performing a Custom TaqMan® SNP Genotyping Assay for 96-Well
Plates Quick Reference Card
4371394
Performing a TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assay for 96-Well
Plates Quick Reference Card
4367636
Pre-Developed TaqMan® Assay Reagents Allelic Discrimination Protocol 4312214
TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays Protocol 4362038
TaqMan® SNP Genotyping Assays Protocol 4332856
xApplied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
前言
与存在/不存在实验相关的文档
与相对标准曲线和比较 CT 实验相关的文档
与标准曲线实验相关的文档
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DNA Isolation from Fresh and Frozen Blood, Tissue Culture Cells, and
Buccal Swabs Protocol
4343586
NucPrep® Chemistry: Isolation of Genomic DNA from Animal and Plant
Tissue Protocol
4333959
PrepMan® Ultra Sample Preparation Reagent Protocol 4318925
文档 部件号
Amplification Efficiency of TaqMan® Gene Expression Assays
Application Note
127AP05
Applied Biosystems High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kits
Protocol
4375575
Custom TaqMan® Gene Expression Assays Protocol 4334429
Primer Express® Software Version 3.0 Getting Started Guide 4362460
TaqMan® Gene Expression Assays Protocol 4333458
User Bulletin #2: Relative Quantitation of Gene Expression 4303859
文档 部件号
Amplification Efficiency of TaqMan® Gene Expression Assays
Application Note
127AP05
Custom TaqMan® Gene Expression Assays Protocol 4334429
Primer Express® Software Version 3.0 Getting Started Guide 4362460
TaqMan® Gene Expression Assays Protocol 4333458
User Bulletin #2: Relative Quantitation of Gene Expression 4303859
xi
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
前言
与试剂指南相关的文档
注意: 有关更多文档,请参阅 xii 如何获取支持
从软件 Help (帮
助)系统中获取
信息
StepOne Software Help StepOne 软件帮助)系统描述如何使用用户界面的每
项功能。要在软件中访问 Help 帮助)系统,请执行下列操作之一:
F1 键。
单击工具栏中的
依次选择 Help (帮助) StepOne Software Help StepOne 软件帮助
要在 Help (帮助)中查找所需主题:
查看目录。
搜索特定主题。
搜索按字母顺序排列的索引。
文档 部件号
Applied Biosystems High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kits
Protocol
4375575
Custom TaqMan® Gene Expression Assays Protocol 4334429
Custom TaqMan® Genomic Assays Protocol: Submission Guidelines 4367671
Custom TaqMan® SNP Genotyping Assays Protocol 4334431
Power SYBR® Green PCR Master Mix and RT-PCR Protocol 4367218
Pre-Developed TaqMan® Assay Reagents Allelic Discrimination Protocol 4312214
Primer Express® Software Version 3.0 Getting Started Guide 4362460
SYBR® Green PCR and RT-PCR Reagents Protocol 4304965
SYBR® Green PCR Master Mix and RT-PCR Reagents Protocol 4310251
TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays Protocol 4362038
TaqMan® Exogenous Internal Positive Control Reagents Protocol 4308335
TaqMan® Fast Universal PCR Master Mix (2
) Protocol 4351891
TaqMan® Gene Expression Assays Protocol 4333458
TaqMan® Gene Expression Master Mix Protocol 4371135
TaqMan® Genotyping Master Mix Protocol 4371131
TaqMan® SNP Genotyping Assays Protocol 4332856
TaqMan® Universal PCR Master Mix Protocol 4304449
User Bulletin #2: Relative Quantitation of Gene Expression 4303859
Using TaqMan® Endogenous Control Assays to Select an Endogenous
Control for Experimental Studies Application Note
127AP08
xii Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
前言
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StepOnePlus 扩增仪 (如年度计划维护或温度验证/校准)时,请与
Applied Biosystems Care Center 联系。要获取中心的电话号码或向中心发送电
子邮件,请登录 http://www.appliedbiosystems.com/support/contact
1-1
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
1
简介 1
本章包括:
关于 StepOne StepOnePlus 系统 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-2
支持的耗材 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-4
准备实验 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-6
选择实验类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-7
选择试剂类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-8
选择检测类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-9
1-2 Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
1
章简
关于 StepOne StepOnePlus 系统
Real-Time PCR System 有两个型号:
StepOne StepOnePlus 系统使用基于荧光的聚合酶链反应 (PCR) 试剂执行检
测,提供:
采用实时分析法定量检测靶核酸序列 (以下简称 “靶序列”
采用 PCR 扩增后 (终点)分析法定性检测靶序列。
PCR 产物的定性分析 (通过发生在 PCR 扩增后的解链曲线分析获得)
关于数据采集 StepOne StepOnePlus 系统可根据扩增仪执行的实验类型,在 PCR 扩增期间
采集不同点上的原始荧光数据:
无论哪种运行类型,数据采集点或 StepOne StepOnePlus 扩增仪
读取
均包
括三个阶段:
1. 激发 扩增仪对扩增仪内反应板上的所有反应孔照明,从而在每次反应
中激发出荧光。
2. 发射 扩增仪光学部件采集从反应板反应孔中发出的残余荧光。设备采
集的结果图像仅包括与发射波长范围相对应的光。
3. 采集 扩增仪以数字形式表现固定时间间隔内采集的残余荧光。
StepOne 软件存储原始荧光图像以便分析
运行之后, StepOne 软件将使用校准数据 (空间、染料和背景)以确定每次
读取中荧光信号的位置和强度、与每种荧光信号相关的染料和信号意义。
系统 特征
Applied Biosystems StepOne Real-
Time PCR System (以下简称
StepOne 系统”
•48 孔平台
三色系统
Applied Biosystems StepOnePlus Real-
Time PCR System (以下简称
StepOnePlus 系统”
•96 孔平台
四色系统
•VeriFlex
样本加热块
实验类型 数据采集点
实时运行 标准曲线 扩增仪在每个 PCR 延伸步骤后采集数据。
相对标准曲线
比较 CT (∆∆CT)
PCR 扩增后
(终点)运行
基因分型 扩增仪在以下时间点采集数据:
•PCR 扩增前 (用于存在/不存在实验, PCR
增前采集数据是可选项,但建议选择此选项。
(可选)在 PCR 扩增期间。扩增仪可在运行期
间 (实时)采集数据;在运行期间采集数据有
助于进行故障排除。
•PCR 扩增后
存在/不存在
1-3
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
1
章简
关于滤光器 StepOne StepOnePlus 系统使用以下滤光器:
关于 VeriFlex
技术
StepOnePlus 扩增仪包含六个单独进行温度调节的 VeriFlex 样本加热块,帮
助优化热循环条件。您可将其中一个或几个 VeriFlex 样本加热块设置为一个
不同的温度,可创建最多六个不同的样本温度区,也可将所有六个 Ve ri Fl ex
样本加热块都设置为同一个温度
有关详情 有关本指南中所述的任何主题的详情,请按 F1 键,单击工具栏中的 ,或
次选择 Help (帮助) StepOne Software Help StepOne 软件帮助),以访
Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR Software v2.0 Help (帮助)
信息。
StepOne 系统 StepOnePlus 系统
滤光器 染料 滤光器 染料
1FAM 染料 1FAM 染料
SYBR® Green 染料 SYBR® Green 染料
2JOE 染料 2JOE 染料
VIC® 染料 VIC® 染料
3ROX 染料 3TAMRA 染料
NED 染料
4ROX 染料
1-4 Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
1
章简
支持的耗材
StepOne 系统 StepOne 系统支持下列耗材。这些耗材可配合标准和 Fast 试剂/验方案使用。
切记! 即使在使用标准试剂执行实验时,在 StepOne StepOnePlus 系统上也
只应使用 Fast 耗材 (反应板、反应管条带和反应管)
耗材 部件号
•MicroAmp
Fast Optical 48-Well Reaction Plate
•MicroAmp
48-Well Optical Adhesive Film
• 4375816
4375323
4375928
•MicroAmp
Fast 8-Tube Strip
•MicroAmp
Optical 8-Cap Strip
• 4358293
• 4323032
•MicroAmp
® Fast Reaction Tube with Cap 4358297
•MicroAmp
Fast 48-Well Tray
•MicroAmp
48-Well Base Adaptor
•MicroAmp
96-Well Support Base
• 4375282
• 4375284
• 4379590
G
A
C
D
C
F
B
C
# 耗材
AMicroAmp
Fast Optical 48-Well Reaction Plate
BMicroAmp
Fast 48-Well Tray
CMicroAmp
96-Well Support Base
DMicroAmp
Optical 8-Cap Strip
EMicroAmp
Fast 8-Tube Strip
FMicroAmp
® Fast Reaction Tube with Cap
GMicroAmp
48-Well Optical Adhesive Film
HMicroAmp
48-Well Base Adaptor
E
B
HH
1-5
Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
1
章简
StepOnePlus
系统
StepOnePlus 系统支持下列耗材。这些耗材可配合标准和 Fast 试剂/实验方
使用。
切记! 即使在使用标准试剂执行实验时,在 StepOne StepOnePlus 系统上也
只应使用 Fast 耗材 (反应板、反应管条带和反应管)
耗材 部件号
•MicroAmp
Fast Optical 96-Well Reaction Plate with
Barcode
•MicroAmp
Optical Adhesive Film
4346906
4366932
4360954
4311971
•MicroAmp
Fast 8-Tube Strip
•MicroAmp
Optical 8-Cap Strip
• 4358293
• 4323032
•MicroAmp
® Fast Reaction Tube with Cap 4358297
•MicroAmp
96-Well Tray for VeriFlex Blocks
•MicroAmp
96-Well Support Base
• 4379983
• 4379590
•MicroAmp
Adhesive Film Applicator
•MicroAmp
Cap Installing Tool (Handle)
• 4333183
• 4330015
G
A
C
F
B
C
# 耗材
AMicroAmp
Fast Optical 96-Well Reaction Plate
BMicroAmp
96-Well Tray for VeriFlex Blocks
CMicroAmp
96-Well Support Base
DMicroAmp
Optical 8-Cap Strip
EMicroAmp
Fast 8-Tube Strip
FMicroAmp
® Fast Reaction Tube with Cap
GMicroAmp
Optical Adhesive Film
D
C
E
B
1-6 Applied Biosystems StepOne™
StepOnePlus™ Real-Time PCR Systems
试剂指南
1
章简
准备实验
一般工作流程 StepOne StepOnePlus 系统上执行实验之前,请按如下步骤准备实验:
1. 选择实验类型 ( 1-7 )。
2. 选择试剂类型 ( 1-8 )。
3. 选择检测类型 ( 1-9 )。
本指南中的信息 本章提供有关您可配合 StepOne StepOnePlus 系统使用的实验类型、试剂类
型和检测类型的一般信息。
后续章节提供具体信息:
章次 描述
2 章 “试剂概述” 描述 Taq Ma n ® SYBR®Green 试剂并进行比较。
提供有关尽量避免 DNA 污染的信息。
3 章 “定量实验”说明实验类型的工作原理。
提供实验类型的特定工作流程。
提供每种检测类型的设计指南。
4 章 “基因分型实验”
5 章 “存在/不存在实验”
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Thermo Fisher Scientific Applied Biosystems StepOne™ Real-Time PCR System 取扱説明書

タイプ
取扱説明書