Thermo Fisher Scientific Applied Biosystems 7900HT Fast Real-Time PCR System SDS Software リファレンスガイド

  • こんにちは!Applied Biosystems 7900HT Fast Real-Time PCR Systemの簡易操作ガイドについてご質問にお答えします。このガイドは、Zymark Twisterマイクロプレートハンドラーを使った自動連続ランの実行方法を中心に解説しています。自動解析機能やメール通知機能の設定方法なども含まれていますので、お気軽にご質問ください。
  • 連続ランを行う際に、どのような方法でプレート情報を登録できますか?
    Automation Controllerを用いた連続ランを行う際に、注意すべき点は何ですか?
    ラン終了後のプレートドキュメントはどうなりますか?
    自動解析の設定はどこで行いますか?
Applied Biosystems
7900HT Fast Real - Time PCR System
Automation Controller 操作ガイド
Rev.A
SDS software version 2.3
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本ガイドはApplied Biosystems 7900HT Fast Real - Time PCR Systemの操作を行う際に必要となる部分のみ
を記載している簡易操作ガイドです。
詳細は装置付属の英文ユーザーガイド をご確認下さい。また本ガイドには知的財産に関するいかなる情報も含
んでおりません。知的財産に関するする情報は英文ユーザーガイドに記載されておりますのでご参照ください。
研究用にのみ使用できます。診断目的およびそ手続き上での使用は出来ません。
The PCR process and 5' nuclease process are covered by patents owned by Roche Molecular
Systems, Inc. and F. Hoffmann-La Roche Ltd.
Applied Biosystems is a registered trademark and AB (Design) and Applera are trademarks
of Applera Corporation or its subsidiaries in the US and/or certain other countries.
詳細については、機器付属のユーザーガイド(英文)を必ず参照ください。
©2006 Applied Biosystems Japan Ltd,. All rights reserved.
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概要
SDSシステムソフウェア簡易操作ガイド
Automation Controller使用方法
Zymark®Twister®Microplate Handler を使用した連続ラン
Applied Biosystems 7900HT Fast Real-Time PCR Systemの自動プレートハンドラ付属モデルで
Zymark®Twister®マイクロプレートハンドラーを使用した動連続ランに対応することができます
またAutomation Controller Softwareによりプレート情報Batchにまとめて連続ランを行うことができます
連続ラン用Plateドキュメントの作成と連続ランの実行フロー
自動プレートハンドラを用いて連続ランを行うに、以下のいずれかの方法でプレートの情報
Automation Controller Softwareに登録(キューの登録)する必要があります。
1.プレート情報の登
 ・ SDSソフトウェアを用いて作成した個別のファイルからPlate Queue作成する方法  (p.4~)
数枚のプレートを使用するランで、プレート毎に定が異なる実験の場合に利用します。
 ・ テンプレートファイルを使用してファイルを複製し、Queueに登録する方法  (p.6)
全プレートすべて同一の実験フォーマットでランを行う場合に利用します。
2. Automation Controller を用いた連続ランの開始
   上記いずれかの方法で登録されたQueueの情報に基づいてランを実行します。
注:Automation Controllerを用いた連続ランを行う場合、バーコードつきプレートを必ずご使用ください。
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個別のファイルからPlate Queueに登録する方法
1. SDS v2.3ソフトウェアでプレートドキュメントを作成します
  ドキュメント作についての詳しい情報は別冊の納品検収補足資料・簡易操作ガイドをご参照ください。
2. Tools メニューから Document Information を選択します
3. Document Information ダイアログが表示され、Barcode フィールド内にカーソルが現れます
4. 付属のバーコードリーダーを使用し、下図の要領でボタンを押してバーコードを認識させます
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5. Barcode フィールドに読み取られたバーコードが表示されます。Document Information 画面下部の
  OKタンをクリックします。
6. Instrument タブかQueue を選択しSend To Queue ボタンクリックします。
7. ドキュメントの保存確認のメッセージが表示されますYes ボタンをクリックします。
8. Queueに登録するメッセジが表示されまので、Yes ボタンをクリックします。
   この操作により Plate Queue に情報が保存されま
9. メッセージが表示されますので、OKを選択します。
10. 複数のプレートドキュメントを登録する必要があれば、上記18操作を繰り返します
11. すべてのプレートドキュメントを登録したら、ソフトウェアを終了します
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テンプレートファイルからプレートドキュメントを複製し、Queueに登録する方
1. SDS v2.3ソフトウェアでプレートドキュメントを作成します
  ドキュメント作についての詳しい情報は別冊の納品検収補足資料・簡易操作ガイドをご参照ください。
2. 作成後、ドキュメントをテンプレートファイル(.sdt形式)で任意のフォルに保存します
3. 2.から連続で操作する場合はすでにドキュメントが開いているので、次に進みます。
  ドキュメントが開いていない場合は保存したテンプレートファイルをFile メニューからOpenで開きます
  
4.  Instrument タブから Queue を選択し、 Send To Queue ボタンをクリックします
5. Template Batchダイアログが表示されま。New ボタンをクリックします。
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6. バーコード入力ダイアログが表示されます。
  付属のバーコードリーダーを使用し、下図の要領でボンを押すとプレートのバーコードが読み取られ
  Template Batch ダイアログにバーコードが自動的に入力されます。この操作をプレート枚数分繰り返します。
  
  
  手入力する場合はPlate IDにバーコードを入力してください。入力を繰り返すときは
   Create Another ボタンをクリックしま
7. すべてのプレートのバーコード読み取りが終了したら、New Plates ダイアログのOKボタンをクリックします
8. 読み取ったバーコードがTemplate Batch ダイアログボックスに表示されていることを確認し、
  Browse ボタンを押してプレートドキュメント保存先を指定します
9. Create ボタンを押すことで登録したバーコードのプレートドキュメントが複製され、
  Queue に自動登録したことを示すダイアログが表示されます。OK ボタンをクリックします。
10. Template Batch ダイアログ下部のDone ボタンをクリックし、ダイアログを閉じます。
11. ソフトウェアを終了します。
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Automation Controller を使した連続ラ
7900HTシステム本体
Zymark®Twister®
Automation Controller
排出スタック(ラン後のプレートストック用)
スタック1
スタック2
スタック3
スタック4
バーコード位置
A1 ウェル
※ラン開始前に排出スタックにプレートが残されていないことをご確認ください。
Snap-on Optical Film
Compression Pad
Optical Adhesive Film
96well Reaction Plate
384 well プレート、Fast 96 well プレートおよび
Optical capで蓋をした96 well プレートの場
はそのままスタックにセットします。
Optical Adhesive Filmでシールした96 well
プレートを使用する場合、 MicroAmp®
Snap-on Optical Film Compression Pad
(PN 4333292)を右図のように組み合わせ、
スタックにセットします
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1. SDS Automation Controller 2.3 ソフトウェアを起動します。
   
2. 7900HTシステム本体、バーコードリーダーおよびAutomation Controllerとのコミュニケーション
  自動的にチェックします。
3. すべてパスすると、Automation controller が起動します。画面構成は下図の通りです。
A : 装置とのコミュニケーション、ランに関する情報が表示されま
   B : Queueに登録されているプレートがリスト表示されます。未登録の場合は空欄になります。
      Plate Queue Queueに登録されているラン未実行のプレートIDが表示されます。
      Plate Status 装置のブロック、サンプル温度変化を常にモニターしグラフ表示します
      Processed Plates ランが終了したプレートIDが表示されま
   C : ランの実行および使用するスタックに関する設定、自動解析設定の設定を行います
Automation Controller を使した連続ラ
AB
C
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4. Automation Robot Settings内の使用するスタックにチェックを入れます。
※オプション
     Enable Batch Settings では下記の設定を行います
        
     Auto Analysis Workflow
    自動解析・データ出力の設
      ラン後に自動的に解析データが出力されます。
        出力するデータおよび保存先は任意に指定できます
  E-mail Notifications
     ラン状況を登録しあるメールアドレスへ 自動送信する設定
       7900HTシステムが施設のIT管理担当者によてネットワーク接続されている場合に
利用できます。
       設定についてはネットワーク知識が必要なため、施設のIT管理担当者にご相談ください。
     各設定を確認・変更する場合はBatch Settings タンをクリックします
     設定確認後、ダイアログ内のOK ボタンクリックしてBatch Settings を閉じます。
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1. 排出スタックにプレートが残ていないことを確認し、使用スタッにプレートをセットします
  セット方法はp.8をご参照ください。
  画面右下のStart Batchボタンを押してランを開始しま
ンの開始
2. ランを開始するRun Status タブ内にラン中の温度モニター状況が表示され、登録されたドキュメントの
  自動ランが行われます。途中で終了する場合は画面右下のStop Batch ボタンをクリックします
解析終了後のプレートドキュメント
ラン終了後のプレートドキュメントに蛍光データが書き込まれますので、個別に再解析を行うことが可能です。
なお、解析については納品説明補足資料・簡易操作ガイドもしくは各アッセイに対応した英文操作ガイドを
ご参照ください。
12 アプライドバイオシステムズジャパン株式会社
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