Roche uPath PD-L1 image analysis for NSCLC IVD Algorithm ユーザーマニュアル

タイプ
ユーザーマニュアル
非小细胞性肺癌 uPath PD-L1 (SP263)
图像分析算法指南
目录
简介 1
算法摘要及解释 2
期用途 3
产品的期用 3
的目的 3
床意义 4
检查原则 5
局限性 6
数据安全 7
NSCLC uPath PD-L1SP263使用流程 8
工作 9
PD-L1 图像 12
PD-L1 评估 15
PD-L1 算染色评估 15
特性 15
特点 26
法比较 26
病理学家的再现性研究 27
扫描仪再现性研究 28
故障排除 29
考资料 33
简介
Roche uPath enterprise software (uPath enterprise
software )是一款配备非小细胞性肺癌(NSCLC)图像分析
算法(NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法)的软件系
统,旨在帮助对以福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)的正常和赘
生性组织的免疫组织化学(IHC)染色的组织切片进行蛋白质
表达的定量评估。
uPath enterprise software 提供端对端的数字病理软件解决
方案,使得病理实验室能对病理标本的数字图像进行获取、管
理、查看、分析、共享和作出报告。病理学家可以利用 uPath
enterprise software 查看各种放大倍数的数字图像、添加注
释、测量组织切片、执行图像分析并生成报告。
注意:用于 NSCLC 算法的 uPath PD-L1(SP263) 图像分析是
作为一种附属的计算机辅助方法,用以帮助从 IHC 染色的组织
标本显微镜玻璃载玻片上获取和测量 PD-L1 蛋白存在的图像。
为确保图像分析的分值有效,病理学家有责任按照《VENTANA
PD-L1(SP263)Rabbit Monoclonal Primary Antibody 方法表》
(见: www.ventana.com)规定的适当对照来进行符合率验证。
非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 1
2 非小细胞性肺癌 (NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南
算法摘要及解
对于图像分析程序,病理学家可使用 uPath enterprise software
选择并列出一个或多个关注区域(ROI),并且可以用不同的
放大倍率查看各个 ROI,然后用 uPath PD-L1(SP263)图像分
析算法对NSCLC进行分析。这将生成一个目标肿瘤细胞(TC)
总数的计数,并且通过 TC 是否被染色将其分层。NSCLC 算法
uPath PD-L1(SP263) 图像分析将染色 TC
数除以 TC 总数
(已染色加未染色),产生一个范围在 0-100%
间的 PD-L1 TC
阳性率。NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法可针对特
ROI 生成分值,也可生成该片上所有选定 ROI 的总分值。
尽管作为整体分析的一部分,该算法会检测非肿瘤细胞,但覆
盖图和输出结果中将仅显示用于计算 TC 阳性率的 TC。病理学
家可以接受 NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法提供的
分值,也可以采用其他替代分值。病理学家必须仔细检查该算
法的阳性 TC 和阴性 TC 标记内容,并确认算法准确性,或进
行手动操作。NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法无法
独立解释数据,因此,只有合资格的病理学家才能结合组织学
检测结果、相关临床信息和适当的对照使用该等分析。设计该
程序旨在帮助病理学家评估 PD-L1 表达在 50% 的情况。
期用途
算法指南的目的
本《NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法指南》
(《算法指南》) 旨在:
N S C L C u Pat h P D -L1 (SP 26 3)
、测
定义必要的材料、IT据安全性和网络要求。
N S C L C u P ath PD - L1 (SP 26 3)
明。
使 N S C L C u P a t h P D - L 1 S P 2 6 3
像分明。
为病理学家提一种辅助工具协助进行VENTANA PD-L1
SP263Assay 染色FFPE NSCLC NSCLC 算法
u P ath P D -L1SP 2 63 析。
为挑战性的案例提供示例图像为如何将 uPath PD-L1(SP263
N S C L C 导。
N S C L C u Pat h P D -L1SP 26 3
产品的预期用途
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法旨在帮助病理学家
对福尔马林固定、石蜡包埋的 NSCLC 组织中的 PD-L1 蛋白进
行检测和半定量测量。当与 VENTANA PD-L1(SP263) Assay
一起使用时,说明是用于辅助鉴定接受 PD-L1 TC 阳性截断值
≥50% (根据经批准治疗产品标签)的疗法治疗 NSCLC 患者。
注意:NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析是一种附属的
计算机辅助方法,用以帮助从IHC染色的组织标本显微镜玻璃
载玻片上获取和测量 PD-L1 蛋白存在的图像。为确保图像分析
的分值有效,病理学家病理学家有责任按照《VENTANA PD-L1
(SP263) Assay 方法表》(P/N 741-4905)中规定使用的适当
对照来进行符合率验证。
该算法的预期用途为体外诊断(IVD)。
非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 3
意义
几十年来,肺癌一直是世界上最常见的癌症,并且目前仍然是
全世界最主要致死性的癌症。据估计,肺癌占所有新增癌症病
例的 12.9%,每年导致全球近 176 万病例死亡,约占癌症相
关死亡病例的五分之一的。1 NSCLC 是最常见的肺癌类型,约
占肺癌病例总数的 85%。2 大部分的非小细胞肺癌患者均患有
无法手术的局部晚期疾病(IIIB 期)或转移性疾病(IV 期),
目前尚无治疗方法。诊断为晚期的 NSCLC 的5年相对生存率为
4.7%。2
程序性死亡配体1(PD-L1)是在活化的 T 细胞上表达的跨膜
蛋白,通过与其两个抑制性受体程序性死亡1(PD-1)和 B7-1
(CD80)的结合下调免疫响应。3 PD-L1 PD-1 的结合会抑
制T细胞增殖、细胞因子生成和溶细胞活性,从而导致T细胞功
能失活或衰竭。PD-L1 还与抗原呈递细胞和活化的 T 细胞上
CD80 结合,介导免疫响应的下调,包括抑制 T 细胞活化
和细胞因子生成。4 在免疫细胞和 TC 中都观察到了 PD-L1
达。5,6 经报告,PD-L1 TC 上异常表达会阻碍抗肿瘤免疫
力,从而导致免疫逃避。6,7 研究表明,对 PD-L1 / PD-1 通路
进行阻断的免疫疗法的出现,提高了 NSCLC 的患者的生存率。
然而,治疗的预后取决于 PD-L1 表达的水平,因此需要用免疫
组织化学染色对 PD-L1 进行定量分析。
免疫组织化学可用于检测组织样品中存在的特定抗原,因而
成为了病理学家诊断和预后癌症的有效工具。VENTANA PD-L1
(SP263)Assay 是一种兔单克隆抗体,旨在用于实验室中对
FFPE 正常和赘生组织切片中的 PD-L1 蛋白进行半定量检测。
组织学组织制备的优点是,完整的组织可以通过其形态帮助
解释患者样本是否为 PD-L1 阳性。所有组织学检查均应由一
NSCLC 形态和/或病理学专家进行解释。检查结果应以形态
学研究、适当的对照加以补充,并与其他临床和实验室数据结
合使用。
4 非小细胞性肺癌 (NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南
原则
uPath enterprise software 带有 NSCLC 算法的 uPath PD-L1
(SP263) 图像分析,采用图像分析技术获得 TC 阳性率。
NSCLC 算法的uPath PD-L1 (SP263) 图像分析使用预定义的参
数对经 VENTANA PD-L1 (SP263) Assay 染色的组织的图像进
行评分。
图像分析涉及的步骤:
空白区域并自动从分析中除。
检测整张图像的细胞。
T C
识别染色与染色 TC
• 根据《VENTANA PD-L1 SP263Assay 方法表将染色 TC
数量TC TC 率。
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法如何识别 TC 及计
算分数:
N S C L C u P a t h P D - L1 S P 2 63 度、
和形态特征来识别 TC。
V E N TA N A P D - L1 S P2 63 A ss a y
T C T C
• 若计算染色 TC 《VENTANA PD-L1 SP263
A s s ay T C T C
NSCLC 算法的 uPath PD-L1(SP263) 图像分析之空白区域确
定:
该算将自动排空白区域尘、之类的
可能会自动除。
用户可以使用伪层检由算确定空白的区域
PD-L1 伪彩色覆盖层
用于生成 TC 阳性率输出的 NSCLC 算法标准 uPath PD-L1
(SP263)图像分析:
N S C L C u Pat h P D -L1 S P 2 63) 告百
至 小 位 , :“ 4 . 8 % ”
建议将数向上或向下取如, 4.8%不应四
5
非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 5
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法旨在用于 VENTANA
PD-L1(SP263) Assay。测试结果的质量和准确性仅取决于成
像的 IHC 载玻片以及随后用于分析的图像。
病理学家必须通过对 PD-L1 对照玻片进行手动显微镜检查,
来验证 VENTANA PD-L1(SP263) Assay 染色运行,以验证玻
片图像载入 uPath enterprise software 进行分析之前,已获
得预期结果。
采取制造商对 VENTANA PD-L1(SP263) Assay 的建议,包括
每次染色运行所用的所有阳性和阴性的质量对照材料。如果经
手动显微镜检查,对照玻片无可接受,则保留结果可接受的组
织。
病理学家必须遵循有关 VENTANA PD-L1(SP263) Assay
解释的建议。
请参阅《VENTANA PD-L1(SP263) Assay 方法表》
(P/N 1014258EN)和《解释指南》(P/N 1015317EN)
(见 www.ventana.com)。
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法旨在服务合资格的
病理学家,结合组织学检查、相关临床信息和适当的对照使
用。该程序之设计为非独立工具,在整体分析过程中需要进行
有效的人工干预。
如果捕获的图像染色异常(核、细胞质等),则 NSCLC uPath
PD-L1(SP263)图像分析算法产生的分值可能不正确。
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法会排除较长的肿瘤
核,不论细胞整体形状为何。因此对包含大量带有细长核细胞
的肿瘤,需要手动进行评估。
局限性
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法已用 NSCLC 组织样
本进行了演练、开发和验证。
尚未对 NSCLC算法 uPath PD-L1(SP263)图像分析过在家
用个人计算机(PC)上进行使用测试及验证其安全性和有效
性。
uPath PD-L1 SP263 图像分析算法旨在用于帮助鉴定 NSCLC
者是否可根据经批准的治疗产品标签规定接受50% PD-L1 TC
阳性率的截断治疗。
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法可能会错误地识别
细胞,因为存在弱细胞质和/或膜性染色,强免疫细胞染色与
肿瘤细胞染色重叠,当中存在明显的混合炎症、细胞质泛红的
TC,和非目标染色。这可能会导致 TC 被误识别为非 TC,而非
TC 被误识别为阳性 TC。
尽管应该将巨噬细胞排除在分析区域之外,但并不总能排除掉
所有巨噬细胞。因此,NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析
算法生成的分数可能会受所分析的 ROI 中的巨噬细胞影响。
当患者分值接近 50% 这一临界值时,这一点至关重要。
细胞质染色通常是弥漫性的,某些情况下细粒度质量良好。罕
见情况下能显示出不同强度的核周点状体染色。可从视觉上估
计肿瘤膜信号强度的总百分比,并将其用于生成 PD-L1 表达水
平。确定 PD-L1 表达水平时,将忽略肿瘤细胞的胞质染色。
使用同型匹配的阴性对照抗体评估是否存在测试样品背景并建
立染色强度基线。
6 非小细胞性肺癌 (NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南
数据安全
恶意软件或未经授权的仪器访问,可能导致数据丢失或仪器不
可用。
为避免恶意软件感染或未经授权访问和仪器滥用,
请务必遵循以下建议:
勿在仪器上安行任软件
请确保网络上的其他计算机和服务有适当的保可以防范恶
意软件和未授权的访问例如实验息系统 (LIS)归档共
、备
应负责保局域的安全,别是防范恶意件和攻击
种保包括设备与不受控制的网络隔离例如设
还包确保已的网络没有恶意代码。
IT (计 线
)的 访
仪器和归档文件不会何未授权访问和灾
事件的损害其中包置远程存储位现站点和确
份文件
如果可能,请使用防火墙限制网络输。
使用USB闪存驱动器进行多种备份和还原。USB闪存驱动器
不当可能导丢失或仪器故障。
使用经当地 Roche 务代表测试及安装的USB闪存驱动
任何时候都使用一个 USB 设备插入USB闪驱动器之前
请先检查是否未插其他USB设备
USB Wi n d o w s 中点出”
E j e c t )按
请勿更改服务器附带的默认操作系统OS置,因为这将影响
OS 配置
u P ath e n t er p ris e s o f t w a re 使
U S B U SB
据。
非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 7
NSCL C u Path PD -L1SP263)使
所需材料
• uPath enterprise software
• NSCLC uPath PD-L1SP263图像析算
B e n c h M a r k U LTR A V E N TA N A PD - L1 S P2 63 A s s ay (使 O ptiVie w DA B I H C D e t e ctio n K it) N S C L C
V E N TA N A D P 20 0
工作流程
1. 使用 BenchMark ULTRA 器通过 VENTANA PD-L1 SP263Assay 法对载玻片上的 NSCLC 组织进行染色
2. 使 V E N TA N A D P 2 0 0 z 2 0
3. 从与 V E N TA N A D P 20 0 IM S
4. u Pat h e nte r p r is e s oft w a r e 使
体) L IS u Pat h e nte r p r ise s oft w a r e
(请 u Pat h e nte r p r is e s oft w a r e PN 10189 4 3Z H
5. N S C L C u P at h P D - L1 S P 2 6 3 u P at h e n t e r p r is e s o f t w a re I M S
并且使 2 0 x u Pat h e nte r p r ise s oft w a r e WSA
6. W S A
7. WS A u Pat h e nte r p r is e s oft w a r e a n a lysis is c o m plete ()。
ROI 行评分病理学家以选择任意ROI 或多ROI果选择ROIWSA 将提供汇分值以及ROI
值。
染色
V E N TA N A P D -L1 S P 2 6 3) A s s ay
便V E N TA N A PD - L1 S P 2 63 A s s a y
• NSCLC uPath PD-L1SP263图像析算法需要使用 VENTANA PD-L1SP263Assay《VENTANA PD-L1 SP263Assay
方法表所列任意其他材料或备件在分对组织进行染色VENTANA PD-L1SP263Assay 定法可检测用 Benchmark
U LTR A O ptiVie w DA B IH C D et e ctio n K it F F P E N SC L C PD -L1 白。 V E N TA N A P D -L1S P 2 63
A s s ay B e n c h m a rk U LT R A F F PE N S C L C P D -L1 白, N S C L C u Pat h PD - L1S P 2 63)
使 B e n c h M a r k U LT R A O ptiVie w DA B I H C D e te ctio n K it
图像抓取
VENTANA DP 200 玻片扫描仪来扫描载玻片。图像必须以 20 倍放大率进行扫描。如果图像的大部分都未清晰对焦,建议重新
扫描载玻片。有关扫描的更多信息,请参阅《VENTANA DP 200 玻片扫描仪用户手册》(PN 1017149ZH)。
整体导航:uPath enterprise software
uPath enterprise software 可根据个人和工作站需求进行定制,包括但不限于:报告配置和用户界面。本《算法指南》将重
点介绍仅用于 NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法所需工具。有关 uPath enterprise software 的更多信息,请参阅
《uPath enterprise software 用户指南》。
8 非小细胞性肺癌 (NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南
病理学家工作流程
打开病例
可双击病例或选择病例并长按 uPath enterprise software 中的 Viewer (查看器) 选项卡(图 1)来访问经 VENTANA PD-L1
(SP263) Assay 进行染色的 NSCLC 组织图像。
将出现一个窗口,显示与病例相关的所有图像(图2)。
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非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 9
VENTANA PD-L1(SP263) Assay 染色的载玻片一经 VENTANA DP 200 玻片扫描仪以 20 倍放大倍数扫描,图像将立即被导入
uPath enterprise software 并与病例关联。NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法将自动触发 WSA。完成 WSA 预计算步骤
的时间取决于服务器规格、图像大小和队列中图像的数量。显示后,“waiting to start auto-analysis”(等待自动分析开)
表示图像 “waiting to start auto-analysis”(正排队等待分析)始),正在执行 WSA 并占用“analyzing”(分析)(图3和4)。
uPath enterprise software 中的 WSA 对图像进行完全分析后,将立即在 uPath enterprise software 查看器中的载波片图像下
方显示“analysis successful”(分析成功)(图5)。在成功完成 WSA 之前无法对图像评分。
绘制整个肿瘤的 ROI:选择肿瘤区域
使用 ROI 下拉菜单(图6)中的“手动”(Freehand)工具按钮,选择要分析的 IHC 载波片图像上的肿瘤区域。图7显示了绘制了
单一 ROI 的图像。也可以绘制其他 ROI。各选中区域都会有 ROI 在“滑动面板”(Slide Panel)中显示(图8)。
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绘制整个肿瘤的 ROI:排除区域
在绘制 ROI 时,可能需要排除某些区域;以下染色特性部分将介绍需排除或省略的特定区域及其示例。使用“排除”
(Exclusion)下拉菜单中的“Freehand”(手动)排除工具(图9)来排除特定区域(图10)。如果图像的大部分区域模糊或聚焦
不清,
请重新扫描载玻片。
该算法不会分析被排除区域,且该区域内被染色和未染色的 TC 都将从总体分析区域中排除。如果已经对 ROI 进行了分析,
之后使用了排除选项,则需重新分析 ROI,覆盖图和分值将适当更新。
绘制大量排除项,特别是进行复杂的“Freehand”(手动)排除,可能会非常耗时且会影响工作流程效率,但对最终分的影响
很小。如果某病例分析时需要进行大量排除,病理学家应执行以下操作:
过绘制多个 ROI 排除被认为不合格的组织部分最大化地减少使用Exclusion”排除具进行排除。
制排工具的使用,用另一个分值手盖该
绘制整个肿瘤的 ROI:删除
如果已选定的整个肿瘤的 ROI不是最佳选择,可以将其删除。单击图像上 ROI的中间位置选中整个肿瘤的 ROI,然后单击
“Slide Panel”(载玻片面板)(图11)或 ROI 旁的载玻片图像(图12)中的“Delete”(删除)按钮。将显示确认窗口。
选择“Confirm”(确认)以删除所选的 ROI。选择“Cancel”(取消)以保留 ROI。
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非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 11
绘制好整个肿瘤的所有ROI和/或排除区域后,便可以对图像进行分析。通过单击要分析的 ROI中间位置或单击“Slide Panel”
(载玻片面板)中的ROI,选中整个肿瘤的 ROI。对于每个ROI,在“Slide Panel”(载玻片面板)中(图13)或在 ROI旁
边(图14)选择“Image Analysis”(图像分析)按钮。
PD-L1分析完成后,结果将显示在“Slide Panel”(载玻片面板)中的两个位置:“载玻片分值”(Slide Score)下和
ROI 旁(图15)。“Slide Score”(载玻片分值)基于所有选定 ROI上肿瘤细胞阳性状态的总和得出,即将在报告中显示
的分值。
PD-L1 图像分析
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您还可以通过单击展开图标(图16)在“Slide Score”(载玻片分值)展开内容和 “ROI Details”(ROI详情)展开内容中查
看更多详细信息。显示“Slide Score”(载玻片分值)展开内容(图17)。单击同一展开图标亦可隐藏此信息。
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PD-L1 图像分析:错误色彩覆盖层
按下“ROI 分析”(ROI(s) Analysis)按钮并进行组织分享后,将在 ROI 上显示颜色覆盖层。在下图(图18)中,
红色圆圈表示确定为 PD-L1 阳性的染色细胞,蓝色圆圈表示确定为 PD-L1 阴性的细胞。抓取图像时(鼠标左键单击并移动图像),
覆盖层将消失(图19)。释放鼠标按钮时,覆盖层会重新出现(图18)。
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非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 13
手动覆盖载玻片输入分值
可以通过单击“Slide Score”(载玻片分值)(图16)旁边的“Slide Panel”(载玻片面板)中的“Slide Score”(载玻片分
值)展开图标来手动覆盖分值。显示“Slide Score”(载玻片分值)展开内容(图20)。选择“载玻片分值”弹出窗口上的编辑按
钮(图20),用户可以键入手动分值(图21)。可通过“注释”(Comments)字段对相关病例和/或决定进行注释,并覆盖自动得
出的分值。对于 PD-L1,可以手动输入 0-100% 的分值。输入手动替代分值后,在通知中选择确认(图22)。将显示一条确认消
息,请选择“是”(Yes)。
“Slide Panel”(载玻片面板)中的分值现在将显示为手动输入的分值。ROI 旁边将不再显示图像分析分值(图23)。
用户可以选择通过按下条形图按钮来重新分析图像(图13和图14)。
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请参阅《VENTANA PD-L1 (SP263) Assay 方法表》和《解释指南》。
PD-L1 评估
VENTANA PD-L1(SP263) Assay 标记的 NSCLC 肿瘤细胞将被评估任意强度下的膜染色 TC 阳性率。NSCLC 中的免疫组织化
学染色是膜和/或胞质染色,并可以在整个肿瘤中均匀或异质表达。肿瘤细胞胞质染色不计入 TC 阳性率。膜染色可能为不连续
的、圆周状或基底外侧染色的形状。使用同种型匹配的阴性对照抗体来评估测试样本中有背景存在。
PD-L1 算法染色评估
使用 NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法的病理学家,应该熟悉用 VENTANA PD-L1 (SP263) Assay 进行手动分值覆盖的方
法。病理学家需使用 “Freehand”(手动)工具圈出整个肿瘤区域。在使用 NSCLC 算法的 uPath PD-L1(SP263) 图像分析之前,
病理学家应参考相关的 H&E 和阴性对照玻片。选择要分析的区域时,请考虑限制和规避区域中所述的限制。如果病理学家不认可
NSCLC uPath PD-L1(SP263)图像分析算法所提供的分值,则应手动覆盖该分值。
不可评估的病例包括但不限于:活体肿瘤不足、形态不可接受和背景受干扰的病例。具有足够活性 TC(由进行评分的病理学家
确定)且 PD-L1IHC载玻片上背景无干扰的NSCLC病例可用于评估。
色特性
非小细胞性肺癌(NSCLC) uPath PD-L1 (SP263) 图像分析算法指南 15
图24: uPath enterprise software 中的经 IHC 染色的 NSCLC 组织的扫描图像;分析前(上图)和分析后(下图)。
红色覆盖层代表确定为阳性染色的 TC 细胞,蓝色覆盖层代表确定为阴性染色的 TC 细胞。
下列附图(24-25)提供了各种染色模式和 PD-L1 表达水平的图像。TC 中的 PD-L1 表达水平以百分比表示(0-100)。
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タイプ
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