Thermo Fisher Scientific SkanIt Software ユーザーマニュアル

タイプ
ユーザーマニュアル
Cat. No. N16707 Rev. 2.0 2018
Thermo Scientific
SkanIt ™ 微孔板读数仪软件
用户手册
软件版本 6.0
© 2018 Thermo Fisher Scientific Inc. 保留所有权利。
Varioskan、Fluoroskan、Multiskan SkanIt Thermo Fisher Scientific Inc. 及其子公司
的注册商标。Excel、Microsoft 和 Windows 是微软公司的注册商标。其他所有商标和注册商标归
其各自所有者所有。
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有互相冲突的信息。
以下为原始说明。
仅供研究使用。不可用于诊断程序。
Thermo Fisher Scientific Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 i
前言
关于本指南
Thermo Scientific SkanIt 微孔板读数仪软件用于控制微孔板读数仪。本指南概括介绍
了软件安装步骤和操作说明。
相关文档
除本指南外,Thermo Fisher Scientific 还提供以下用于 SkanIt 软件的电子文档:
Thermo Scientific™ SkanIt™ Software for Microplate Readers Technical Manual (Cat. No. N16046)
软件还提供帮助。
安全和特殊说明
请务必遵守本指南中提出的防范说明。安全和其他特殊说明写于方框中。
安全和特殊说明包括以下内容:
注意 强调对人、财产或环境的危害。每条 注意 都伴有相应的 CAUTION 符号。
重要 强调防止软件损坏、数据丢失或测试结果无效所需使用的信息;或者可能包含对
于达到系统最佳性能十分关键的信息。
备注 强调一般性信息。
提示 强调可能简化任务的有用信息。
前言
ii Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
联系我们
如欲获取产品和服务的最新信息,请访问我们的网站,网址为:
www.thermofisher.com/platereaders
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关于本指南 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
相关文档 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
安全和特殊说明 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
联系我们 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ii
1 安装 SkanIt Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
SkanIt Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
安装概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
主要元素 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
应用菜单 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
程序 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
任务功能区 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
选择软件语言 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
2 使用 SkanIt 软件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
会话 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
会话结构 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
板布局 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
操作步骤 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
操作动作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
开始检测 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
结果 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
计算操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
报告 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
已保存会话 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
打开已有的会话 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
目录
目录
iv Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
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安装 SkanIt Software
本章概括介绍了软件安装过程,并对用户界面中的主要元素进行了说明。欲了解更多关于
该软件的信息,请参见
Thermo Scientific SkanIt Software for Microplate Readers
Technical Manual
软件会自动检测仪器的配置情况,并只会显示可用的功能。
SkanIt Software
您可以利用 SkanIt Software:
• 控制仪器操作。
• 创建检测会话并开始检测。
• 查看测量结果并执行数据分析。
• 创建全面的结果报表。
以不同文件格式打印或导出结果报 (例如 Microsoft ™ Excel ™)
所有测量和计算数据都存储在文件系统中。
安装概述
要安装 SkanIt Software,您需要:
具备 PC 管理员权限
包含安装软件的 U 盘 (或者通过安装网站进行安装)
确保您的 PC 符合最低要求。
备注 您的仪器可能并不具备本指南中介绍的所有功能。
1 安装 SkanIt Software
主要元素
2Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
安装过程
1. 将安装 U 盘插入 USB 端口。(或者登录安装网站)
如果此安装窗口未打开,请在 U 盘中打开 Setup 文件。
2. 按照安装说明进行操作。
3. 安装结束时会显示 “ 已成功安装应用程序 ” 消息。
4. 要打开软件,请点击桌面上的 SkanIt Software 快捷方式。
欲了解详细安装步骤,请参见
Thermo Scientific SkanIt Software for Microplate
Readers Technical Manual
主要元素
软件中的主要元素是应用菜单、程序以及任务功能区。您打开软件时,应用菜单随即打
开。
应用菜单
应用菜单用于一般任务。您可在此处创建新程序、打开已保存的程序以及访问仪器设置。
在应用菜单中,您也可以访问 SkanIt 云资源库查找已创建的会话进行常规检测。欲了解
详细信息,请参见
Thermo Scientific SkanIt Software for Microplate Readers
Technical Manual
表 1. 对PC的
系统 对PC的
支持的操作系统 64 Microsoft ™ Windows ™ 7 (带 Service Pack 1)、64
Microsoft ™ Windows ™ 8.1 64 Microsoft ™ Windows ™ 10
磁盘空间 具有 14 GB 空间的 SSD (固态硬盘)
处理器 四核 (或带四个逻辑处理器的双核),2 GHz 或更高配置
内存 8 GB RAM
可用 USB 端口 1 (一个)
图形处理单元 专用
显示器 分辨率为 1280 x 1024 SXGA 示器
备注 若处理测量值总数超过 15 万个或计算复杂的会话,我们强烈建议使用高于以上
要求的计算机 (特别是 RAM 存储器)
1 安装 SkanIt Software
主要元素
Thermo Fisher Scientific Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 3
图 1. 应用菜单。
程序
您创建或打开了会话后,就可以看到程序。此处是定义要检测的孔井、选择操作、查看检
测结果、进行计算以及创建结果报表的主要区域。
图 2. 选择了板布局的程序。
任务功能区
任务功能区中的操作与您在程序中选择的部分相关联。当您在程序中选择板布局操作
结果报表时,相应的任务功能区会打开。任务功能区会显示您可以选择的操作。
1 安装 SkanIt Software
选择软件语言
4Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
图 3. 操作任务功能区。
选择软件语言
默认语言为英语。您可以将语言改为法语、德语、意大利语、日语、葡萄牙语、俄语、简
体中文或西班牙语。
要更改语言:
1. 请点击应用菜单中的设置
会打开设置窗口。
2. 从一般设置下的下拉列表中选择语言。
3. 重新启动软件,设置新语言。
图 4. “设置”窗
Thermo Fisher Scientific Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 5
2
使用 SkanIt 软件
本章介绍的程序是软件用户界面的主要组成部分。您将了解到如何创建会话、查看和导出
检测结果、进行计算以及创建数据报表的相关信息。
使用软件的一般使用方法如下:
1. 创建新程序或打开已有程序。
2. 定义板布局和操作。
3. 启动会话。
4. 查看结果并进行计算。
5. 创建结果报表并导出数据。
会话
定义和运行检测所需的信息保存在
会话
中。您可以通过 SkanIt 软件构建用于您自己的检
测的会话,并运行或修改已创建的会话。
会话结构
程序是软件中的主要使用区域。程序包括五个主要部分:
1. 备注 - 记录关于会话的注释。
2. 板布局 - 定义使用哪一种微孔板型或类型,以及测量微孔板的哪些孔井。
3. 操作 - 定义您希望仪器执行哪些操作 (例如检测、振荡)
4. 结果 - 查看检测结果并选择您的计算方法。
5. 报表 - 创建检测和计算结果报表
2 使用 SkanIt 软件
板布局
6Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
图 5. 程序。
创建和保存会话
1. 点击应用菜单选项卡。
2. 点击新建和最近下的新建程序
3. 点击主页功能区中的保存以保存会话。
4. 在另存为会话窗口中,选择您要保存会话的文件夹。
5. 为会话命名,点击保存
在首次保存之后,您可以选择另存使用新名称保存所有协议和测量数据。选择另存为新
可只保存协议,不保存测量数据。
板布局
您在此告知软件要检测 (或分配)哪些孔井以及您的微孔板中由哪类样本。加样内容部分
是定义样本属性的位置。虚拟移液管部分是将样本加到板上的位置。
您可以将 “ 板布局 ” 留空。仪器随后会自动对整个板进行检测。
图 6. 板布局中的加样内容部分 (左侧)和虚拟移液管部分 (右侧)
2 使用 SkanIt 软件
操作步骤
Thermo Fisher Scientific Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 7
定义板的样本
1. 点击程序中的板布局
2. 从下拉列表中选择板型模板。
3. 选择样本类型和样本属性。
4. 用虚拟移液管 (您的光标)点击板孔井,添加样本。
要清除或编辑孔井,请右键单击该孔井。
图 7. 示例:要添加一系列标准样本 (浓度 5、10、50、100 和 500µl/ml) ,两个相同的
样本并排放置,请按下图所示选择加样内容参数,并用虚拟移液管涂绘孔井,以
此向板添加样本:
操作步骤
此处可以定义仪器执行的操作。仪器会按照协议中列出的顺序执行操作。
提示 您可以通过将移液管拖动到孔井上的方式一次添加多个样本。
2 使用 SkanIt 软件
操作步骤
8Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
图 8. 本例中,仪器先会将液体分配到孔井中,然后会振动板,随后开始对荧光进行检
测。
定义操作
1. 点击程序中的操作
2. 从操作功能区中选择操作。操作会出现在程序中。
3. 定义操作参数,例如检测波长。
要更改操作顺序,请点击您要移动的操作,然后点击小箭头将其上移或下移。
图 9. 要上移或下移操作,请点击箭头图标。要移除操作,请点击 X 号。
操作动作
操作功能区中选择协议操作。
图 10. 用于添加操作的协议功能区。
备注 软件会自动检测仪器配置,并只会显示可用的操作。
2 使用 SkanIt 软件
操作步骤
Thermo Fisher Scientific Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 9
图 11. 动力学发光 测量示例。
表 2. 操作动作和描述。
操作 说明
吸光度 检测吸收率。
吸收光谱 检测某一波长范围的吸收光谱。
荧光 检测荧光强度。
荧光光谱 检测某一波长范围的荧光光谱。
化学发光 检测化学发光。
化学发光光谱 检测某一波长范围的化学发光光谱。
AlphaScree 测量 AlphaScreen®/AlphaLISA®/AlphaPlex® 信号。
TRF 检测时间分辨荧光。
TRF 光谱 检测某一波长范围的时间分辨荧光光谱。
动力学循环 在动力学检测中,在定义的时间间隔内多次执行子步骤
孔循环 一次对您所选数目的孔井执行子步骤。
区域选择 仅对板布局中定义的那部分孔井执行子步骤。如果要检测板
布局中所有已定义孔井,则不需要进行区域定义。
振荡 振荡微孔板,混合孔井中的液体。
分液 将给定体积的液体分配到孔井中。
暂停 暂停操作。
进 / 出板 在操作中间执行板进 / 出操作。
提示 要进行动力学检测,应以动力学循环子步骤的形式添加检测步骤。
2 使用 SkanIt 软件
开始检测
10 Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
开始检测
1. 点击开始按钮。
如需设置孵化温度,可点击温度。
图 12. 温度和 “ 开始 ” 按钮。
2. 在程序名称栏中写入程序名称。
如果您之前已为会话命名,可省略此步骤。
3. 点击保存开始检测。软件会指示其正在执行的操作。
4. 点击结果下的操作可查看执行过程中的检测结果。
如果您需要停止执行,请点击中止。会保存中止前的检测结果。
图 13. 发光测量。
结果
您可在此处查看检测结果并进行计算。您还可以到处检测和计算数据,在 SkanIt 软件以
外使用。
查看结果
1. 点击程序结果下的检测步骤。
2. 点击列表选项卡查看结果。
重要 检测过程中,请勿打开检测室门。
2 使用 SkanIt 软件
计算
Thermo Fisher Scientific Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 11
图 14. 打开板视图时显示的发光测量结果。
将结果导出到 Excel 中
1. 在结果视图中,点击导出到 xcel 选项卡。
2. 保存数据。
计算
软件内置了可用于进行数据处理的计算功能。您可以在检测前或检测后添加计算功能。您
可以添加多个计算功能进行检测,也可以嵌套使用计算功能。
计算功能会使用程序中位于其正上方的结果数据。
添加计算
1. 在程序中选择您要用作计算源数据的结果步骤。
2. 点击结果功能区中的计算操作。操作会出现在程序中。
3. 定义计算参数 (若需要)
4. 点击列表选项卡查看计算结果。
5. 点击保存
提示 可以通过创建报表的方式将多个步骤的数据导出到同一文件中。您可以创建
Excel、PDF、XML 和 TXT 格式的结果报表。
2 使用 SkanIt 软件
计算
12 Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
图 15. 本例中,荧光检测数据是空白减法计算的源数据、空白减法数据是标准曲线的源
数据。
计算操作
结果功能区中选择计算操作。
图 16. 用于添加计算的结果功能区。
表 3. 计算操作和描述。
操作 说明
减去空白 从所有样本中减去平均试验值。
平均,SD,CV% 计算重复样本的平均标准偏差 (SD) 以及变化系数 (CV%).
基本计算 进行简单计算,如减法、乘法和除法。
稀释倍数 将未知样本的结果与板布局中定义的稀释系数相乘。
归一化 将样本组数据标准化到 B0参考样本。结果会以百分数的形式
显示。
光程校正 标准化吸收率检测数据,使其对应于 10 mm 光程长度 (=
准试管)
标准曲线 根据由标准样本序列生成的标准曲线计算样本浓度。
剂量响应 计算 50% 的已检测样本操作丢失时的浓度 (= ED50)。
动力学 为动力学数据提供不同的计算类型。
光谱 为光谱数据提供不同的计算类型。
多点 提供不同的计算类型,将每个孔井中的多点检测结果减少为
每个孔井一个结果。
分类 根据用户定义的限值将样本划分到单独的列表中。
2 使用 SkanIt 软件
报告
Thermo Fisher Scientific Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 13
报告
您可以创建包含检测数据和计算数据在内的结果报表。您可以将结果报表导出为 Excel、
PDF、XML 和 TXT 格式。
汇总表会自动在 “ 报表 ” 下方生成。汇总表仅会显示终点检测的检测结果和计算结果。
动力学、光谱或多点结果不包含在结果汇总中。
您可以通过选择各个结果部分的方式将任何数据导出到报表中。
创建数据报表
1. 点击程序中的报表
2. 从报表部分列表中勾选您要包含在报表中的部分。
图 17. 勾选了报表部分后打开的报表窗格。
手动导出结果报表
1. 点击报告功能区上的 PDF、Excel、XML 或 TXT 格式,导出报表。
质量控制 根据已知的控制样本等条件检查试验的有效性。
自定义公式 允许您创建自定义计算。
合并数据 可将若干个动力学和 / 或终点法测量结果合并至一个动力学
数据集中。
图形 通过结果数据创建图表。
表 3. 计算操作和描述。
操作 说明
2 使用 SkanIt 软件
已保存会话
14 Thermo Scientific SkanIt ™ 微孔板读数仪软件 Thermo Fisher Scientific
图 18. “报告”功
2. 保存报表。
报表会自动以您选择的格式打开。
自动导出结果报表
您可以将软件设置为运行到特定终点后自动导出报表。
运行会话之前,您需要选择报表内容以及报表的导出位置。
1. 点击程序中的报表
2. 勾选执行后自动导出窗格中的保存到文件框。
3. 为文件命名,并点击浏览择目标文件夹和文件格式。
4. 保存会话。
下次打开会话时,报表会自动保存在您选择的目标文件夹中。
已保存会话
有两种不同类型的已保存会话:
a. 一种是运行之前保存的会话
一种是已保存但并未运行、不包含检测数据的会话。您可以编辑所有内容。
b. 已运行的会话。
已运行的会话会自动保存。您不能编辑操作,但可以编辑所有其他内容。绿色箭头
图标指示包含检测数据的已保存会话。
图 19. 包含检测数据的会话 (绿色图标)和不包含检测数据的会话 (无图标)
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タイプ
ユーザーマニュアル